Mit dem PDF24 Creator lassen sich mehrer PDF zu einem zusammenfügen. In den benutzerdefinierten Einstellungen kann man die Seitenzahlen zufügen.
Nachdem du die PDF eingefügt hast, klickst du wie gehabt auf das Speichern-Symbol. Klicke im Fenster Ausgabeprofil wählen auf Benutzerdefiniert.
In dem neuen Fenster klickst du auf den Menüpunkt Seitennummern und setzt den Haken bei Verwende Seitennummern.

Im selben Fenster lassen sich noch einige Einstellungen für die Darstellung der Seitenzahlen einstellen.
Bei Fragen oder Anregungen freue ich mich natürlich über eure Kommentare.